Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC4Q8N9L1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms