Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms