Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ITPK1-209ENST00000556185 691 ntTSL 511.48□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.619e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.641e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TEFM-202ENST00000541382 559 ntTSL 211.02□□□□□ -0.659e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-24■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-24■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TPCN1-215ENST00000550873 527 ntTSL 510.89□□□□□ -0.679e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.679e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 NBN-208ENST00000519426 535 ntTSL 410.86□□□□□ -0.679e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-24■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.689e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SUCLG1-204ENST00000483605 655 ntTSL 310.69□□□□□ -0.79e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.79e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 PRKD2-211ENST00000598633 541 ntTSL 510.62□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.719e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.719e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SEMA4F-206ENST00000446927 2672 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.722e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.739e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.749e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SUCLG1-202ENST00000430989 571 ntTSL 410.25□□□□□ -0.779e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 OAS3-204ENST00000546973 499 ntTSL 310.21□□□□□ -0.779e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 PSMD2-214ENST00000485937 603 ntTSL 210.19□□□□□ -0.789e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 GSKIP-203ENST00000554182 760 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 NSMCE1-209ENST00000565384 580 ntTSL 310.06□□□□□ -0.89e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TOGARAM1-206ENST00000555945 3908 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.819e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HTD2-203ENST00000475412 648 ntTSL 39.96□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 DNAH17-203ENST00000586052 6551 ntTSL 59.72□□□□□ -0.859e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 POP5-204ENST00000535245 608 ntTSL 39.72□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.869e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.879e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TPCN1-223ENST00000552985 762 ntTSL 39.61□□□□□ -0.879e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ZDHHC3-210ENST00000478669 778 ntTSL 59.44□□□□□ -0.99e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SUCLG1-203ENST00000442240 568 ntTSL 59.36□□□□□ -0.919e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 VPS26B-203ENST00000525918 621 ntTSL 29.33□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TOGARAM1-204ENST00000555607 4992 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RIN1-208ENST00000627248 243 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.939e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.959e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HTD2-204ENST00000476007 847 ntTSL 29.06□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KRBOX4-201ENST00000298190 1354 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.979e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HAUS2-202ENST00000391623 2853 ntTSL 28.97□□□□□ -0.979e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TCTN2-201ENST00000303372 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.989e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG8-204ENST00000525755 838 ntTSL 38.94□□□□□ -0.989e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -13e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 DNAH17-208ENST00000591369 5220 ntTSL 58.75□□□□□ -1.019e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ICE2-213ENST00000561114 3796 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.019e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX11-211ENST00000582481 627 ntTSL 28.62□□□□□ -1.039e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TEFM-201ENST00000306049 1262 ntTSL 28.55□□□□□ -1.049e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG8-220ENST00000532552 645 ntTSL 58.44□□□□□ -1.069e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 PTDSS2-210ENST00000530087 596 ntTSL 28.4□□□□□ -1.076e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 POP5-208ENST00000542776 821 ntTSL 28.38□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX11-206ENST00000580219 1200 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.089e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 BROX-207ENST00000537020 3670 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.099e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX11-205ENST00000578861 571 ntTSL 48.2□□□□□ -1.19e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 INPP5D-206ENST00000465281 568 ntTSL 28.2□□□□□ -1.19e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 EOGT-203ENST00000403140 2243 ntTSL 28.18□□□□□ -1.12e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0355-203ENST00000588338 561 ntTSL 58.13□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TTC27-203ENST00000433416 660 ntTSL 38.09□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 NABP2-205ENST00000447747 770 ntTSL 58.09□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.129e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MCM6-203ENST00000492091 712 ntTSL 57.97□□□□□ -1.139e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-220ENST00000627781 383 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.149e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 AC099811.2-201ENST00000585562 646 ntTSL 37.83□□□□□ -1.169e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 BROX-208ENST00000539697 3734 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.169e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RPP14-205ENST00000463550 658 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.179e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 DOCK4-213ENST00000486186 3304 ntTSL 27.74□□□□□ -1.179e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MAN2A2-226ENST00000560926 569 ntTSL 47.74□□□□□ -1.179e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.179e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 TPCN1-209ENST00000547275 564 ntTSL 47.52□□□□□ -1.219e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.229e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX11-213ENST00000584335 922 ntTSL 57.39□□□□□ -1.239e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 APPL1-208ENST00000495803 396 ntTSL 57.34□□□□□ -1.239e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.249e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HAUS2-204ENST00000563479 590 ntTSL 37.19□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HAUS2-209ENST00000570178 861 ntTSL 37.19□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 BUB1-208ENST00000468927 714 ntTSL 57.06□□□□□ -1.281e-10■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.319e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.359e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 VAV3-209ENST00000525460 1423 ntTSL 26.55□□□□□ -1.369e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MACF1-220ENST00000485063 438 ntTSL 36.52□□□□□ -1.379e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RAD51AP1-214ENST00000544931 1024 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RGS5-210ENST00000531954 581 ntTSL 46.42□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MAN2A2-225ENST00000560880 718 ntTSL 26.41□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG8-218ENST00000532306 844 ntTSL 56.33□□□□□ -1.49e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MAN2A2-207ENST00000558374 731 ntTSL 36.32□□□□□ -1.49e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MAN2A2-208ENST00000558538 576 ntTSL 46.32□□□□□ -1.49e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MTAP-203ENST00000427788 753 ntTSL 56.22□□□□□ -1.419e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 CCDC91-206ENST00000538586 471 ntTSL 46.21□□□□□ -1.419e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX11-208ENST00000581298 563 ntTSL 56.2□□□□□ -1.429e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ICE2-203ENST00000558181 7060 ntTSL 1 (best)6.2□□□□□ -1.429e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 NBN-206ENST00000517337 565 ntTSL 46.19□□□□□ -1.429e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SNX11-204ENST00000577310 358 ntTSL 36.09□□□□□ -1.439e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 METTL8-216ENST00000483284 1880 ntTSL 25.94□□□□□ -1.469e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.462e-16■■■■■ 32.9
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 467.4 ms