Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms