Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC39AQ5SRH9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms