Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC23Q53EV4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms