Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms