Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms