Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSPP1Q1MSJ5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSPP1Q1MSJ5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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