Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPRNQ16849 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTPRNQ16849 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRNQ16849 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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