Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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