Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms