Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SF1Q15637 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SF1Q15637 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SF1Q15637 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SF1Q15637 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms