Protein–RNA interactions for Protein: Q15375

EPHA7, Ephrin type-A receptor 7, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA7Q15375 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EPHA7Q15375 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA7Q15375 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms