Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAM2Q15035 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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