Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAPTM4AQ15012 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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