Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR1D2Q14995 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NR1D2Q14995 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR1D2Q14995 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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