Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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