Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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