Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1CQ13936 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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