Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ATP1A4Q13733 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ATP1A4Q13733 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ATP1A4Q13733 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ATP1A4Q13733 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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