Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE3BQ13370 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms