Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SEMA3FQ13275 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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SEMA3FQ13275 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SEMA3FQ13275 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SEMA3FQ13275 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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