Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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