Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPAL4Q0D2K0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms