Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms