Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms