Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms