Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms