Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF8Q02556 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms