Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK16Q00536 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK16Q00536 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms