Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFM1P61960 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms