Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP4P49662 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP4P49662 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP4P49662 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms