Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTPAP49638 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTPAP49638 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms