Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNI2P48788 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms