Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms