Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEACAM3P40198 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms