Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRS3P32247 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRS3P32247 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms