Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms