Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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