Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLD1P28340 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLD1P28340 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLD1P28340 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLD1P28340 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLD1P28340 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms