Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms