Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERBB3P21860 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERBB3P21860 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms