Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASTP20810 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASTP20810 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASTP20810 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASTP20810 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASTP20810 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASTP20810 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASTP20810 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASTP20810 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASTP20810 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASTP20810 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms