Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD53P19397 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD53P19397 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms