Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB6P18564 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGB6P18564 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms