Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms