Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms