Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms