Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APODP05090 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APODP05090 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APODP05090 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APODP05090 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APODP05090 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APODP05090 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms